大结局是忍者都死了。
这部作品最后就是甲贺忍者和伊贺忍者都只剩下一个人,而他们既是恋人也是正在执行任务的忍者,无论如何都必须分出胜负,而忍者只有死亡的时候才会被判为失败,男主无奈之下只好自杀,女主不忍心也跟随着一起死了。