20多年以前，一艘巨大的外星飞船出现在南非首都约翰内斯堡的上空，不知道来者意图的人类一时不知所措，但在惶恐中等待了几个月之后，失去耐性的人类终于还是决定做出主动接触--登上外星飞船。
结果是让地球人难以预料的，整个飞船有如巨大的难民营，里面有数百万浑身上下肮脏不堪、严重营养不良、长相有如大虾的外星人。尽管有着足够让地球人胆寒的先进科技和武器，眼前的这些“大虾”却着实让人们费解。一开始，出于人道主义考虑和对外星文明多少存在一定敬畏的心理，地球人用各种物资来救助这些外星难民，但时间一久，外星人丑陋的外表，粗俗的行径和野蛮的生活方式逐渐让地球人对他们失去了兴趣，鄙视之情开始蔓延，终于，20多年过去后，外星难民彻底沦为了社会最底层的阶级--人们专门在南非建立一个名为“第九区”的贫民窟用来隔离他们。名为MNU(Multi-National United)的多联社表面上指派专员在第九区与外星人交涉，签署驱逐协议，实际上却是把目光聚焦在破解可怕外星武器上，这与盘踞在第九区的地球人黑帮首领的阴谋如出一辙。多联社是世界上第二大武器制造商，他们的秘密研究发现，外星武器的启动需要外星人的DNA。 年轻朴实的专员怀可是多联社社长的女婿，受到岳父的照顾刚刚获得升职的他被委以重任--负责让外星人签署接受搬迁的协议。但在行动中的一次意外事故中，怀可被外星物质弄伤，由此体内发生了巨大的变异。DNA的变种使他变得越来越像外星人！ 然而等待惊慌失措的怀可的，不是亲人的关怀和及时的救助，他在岳父的眼中顿时变成了一件地球上最有价值的商品，他是第一个成功吸收了外星人基因而存活的人类，而这也使他成为了多联社开发外星武器实验中最重要的一环。一连串的非人道试验在等待着他，最终科学家们会将他肢解到能解决外星DNA在人类体内共存的问题为止。怀可奋力反抗并逃出了MNU，但之后就开始了自己的逃亡生涯，势力庞大的MNU给他安上各种莫须有的罪名，使其众叛亲离，此时的怀可开始感受到世态炎凉，无处可躲的他只剩下一个地方可去--第九区。 一面，怀可忍受着身体畸形变异的痛苦，一面又要摆脱成为“医学实验品”的追捕，就连黑帮首领也贪图怀可身上“未知病毒”的杀伤力。在第九区藏匿的日子里，怀可逐渐开始从外星人的角度来看他们的遭遇，为了摆脱自己的命运，怀可与藏身在第九区的外星人克里斯托弗协力冒险，事实上他接触到的外星物质是一种燃料，只要取回这种外星燃料就能让外星生物飞回自己的星球，百般阻挠之下一场化解人类危机的恶战一触即发……
