1、制作方法：制作菌种首先要制作母种，母种也就是一级种。因处于保存期的大球盖菇母种，菌丝生长缓慢或停止生长，需进行复壮。
2、原种制作：所谓的原种也就是蘑菇的二级种，是用来接种制作栽培种。大球盖菇的菌丝生长较为缓慢，是常规的原种制作方法，当大球盖菇菌丝在培养料中生长到一定程度，生长速度会逐渐减慢，甚至停止生长，这样即使是3～4个月也不能长满菌瓶。
甚至会导致菌丝老化失去活性，影响了原种的质量。制作菌种的时候通常采用摇瓶的方法来刺激菌丝的生长，提高菌丝的密度。这样处理后一般原种制作整个过程只需20天左右即可。
3、栽培种制作：用于栽培种制作的配方、培养料、容器与原种制作相同。为刺激菌丝的生长，也需对菌瓶进行抖动处理。选取长满瓶、生长茂盛、无污染的菌种，在无菌环境下，用接种工具将原种搅拌使其散开，再用接种铲将原种接种至装有培养料的菌瓶中。
