1、扣缴对象不同：
指定扣缴通常是针对某些特定的收入支付人进行的，由其在支付所得款项时直接向税务机关缴纳预扣税款。
源泉扣缴则是广泛适用于各类企业和个人，由其自主完成税款的预缴和申报。
2、缴纳时间不同：
指定扣缴是在支付所得款项时即时缴纳，属于即时性扣缴。
源泉扣缴则是按照规定的期限进行预缴和申报，需进行较长时间的预测和计划。
3、税率和计算方式不同：
指定扣缴的税率通常为固定比例，计算方式相对简单明确，但可能会因为收入支付人的情况不同而存在差异。
源泉扣缴的税率则根据不同税种、收入类型等因素而有所不同，计算较为复杂。
4、审核检查方式不同：
由于指定扣缴是由支付人直接向税务机关缴纳预扣税款，因此审核和检查的过程通常相对简单
源泉扣缴涉及到较多的资料和凭证，需要进行详细的审核和检查。
