你好，金刚菩提可以通过以下方式进行深度清理：
1. 水洗法：将金刚菩提放入清水中，用手轻轻搓洗，然后用清水冲洗干净。
2. 烟熏法：将金刚菩提置于熏香或草木烟中，让其吸收香气，同时烟熏的功效也可以清理金刚菩提。
3. 霉菌清除法：将金刚菩提置于阳光下暴晒，或放在通风干燥的地方，可以有效清除金刚菩提上的霉菌。
4. 磨砂法：用细砂纸或磨刀石轻轻擦拭金刚菩提表面，去除表面的污渍和瑕疵。
5. 颜色复原法：将金刚菩提放在沸水中浸泡几分钟，然后取出晾干，可以使其颜色恢复原状。
需要注意的是，金刚菩提是一种比较特殊的佛教用品，清理时要遵循佛教的礼仪和规矩，不可随意处理，以免破坏其神圣性质。
