、叶片不同
侧柏和柏树都是柏科类的植物，但侧柏的叶片是叶鳞形，中间部分是倒卵状的菱形，背面有条状腺槽，是扁平的叶片，柏树的叶片是鳞叶二型，叶面的背部是条状腺点且有棱脊，是饱满充实的叶片。
2、枝条不同
侧柏的枝条是向上方伸展或是斜方伸展，幼树是卵状尖塔形，成熟树冠是宽广的圆形，柏树的枝条则是向下垂，嫩枝是排成平面的扁枝，成熟枝则是有光泽的圆柱形。
3、颜色不同
侧柏的树干颜色是灰褐色，叶片的颜色是较暗的深绿色，雄性球花是黄色，种子成熟时呈紫褐色，柏树的树干颜色是淡褐灰色，叶片的颜色是较浅的翠绿色，雄球花是淡绿色，种子成熟时呈淡褐色。
4、习性不同
侧柏对环境和土壤的要求不高，能在冷凉气候生长，稍耐阴也耐高温和强光照射，是浅根性树种，柏树喜欢温暖、潮湿的环境，耐瘠薄也稍耐水湿侧，根比较发达。
