莲藕最佳贮藏温度为5℃，不宜太低，否则会使莲藕组织发生软化而无食用价值。若短期保存，没切过的莲藕可在室温中放置一周的时间;但因莲藕容易变黑，切面孔的部分容易腐烂，所以切过的莲藕要在切口处覆以保鲜膜，也可冷藏保鲜一个星期左右。若需保存较长时间，可采用如下方法：
1、清水保存法先把要存放的莲藕洗干净，放入非铁质容器如水缸内，加满清水，每星期换水1次，可存放1～2个月，并且能保持其白嫩鲜脆。
2、土坑储存法先挖个土坑，在坑底铺一层细湿土，然后选择品质好、茎粗壮、根完整的莲藕平整地铺放一层，接着在上面撒上一层细土，再铺一层莲藕，如此可叠放5～6 层，最上层再盖上10 厘米厚的细土，最后盖上一层厚厚的树叶、柴草即可。可保存2个月左右。
3、盐水保存法先把要存放的莲藕洗干净，放入非铁质容器如水缸内，按顺序排好，加满10%～15%的食盐水，可保鲜5个月以上;且因食盐难以渗入莲藕内组织，既可防腐又能抑酶，贮藏后风味与新鲜时无异。
