1、选拔制度不一样
妇女联合会主席采用无记名投票方式。妇女代表大会选举执委时，可以采取候选人数多于应选人数的差额直接选举办法进行；也可以采取差额选举办法进行预选，产生候选人人选，然后进行等额正式选举。
妇联主任是妇女代表大会选举出来的代表。
2、职责不一样
妇联主任负责贯彻执行上级妇联组织及同级妇女代表大会决议；指导所辖农村妇代会开展妇女工作；加强与乡镇内单位及其妇女组织的联系与合作；
以及培育以妇女为主体会员的协会、联谊会和农村经济合作组织等基层群众组织，推进乡镇妇女工作的社会化；加强乡镇妇联自身建设，提高乡镇妇联干部的学习能力、创新能力和服务能力。
妇联主席负责妇女代表大会的日常工作，妇女代表大会每三至五年举行一次。
3、领导机构不同
妇联主席的领导机构是妇女代表大会，妇女代表大会闭会期间的领导机构是执行委员会。执行委员会全体会议选举主席一人、副主席若干人。执行委员会全体会议，一般每年举行一次。 妇联和农村妇代会接受同级党组织和上级妇女联合会的领导。
4、级别不同
乡镇街道办及上一级的妇女干部称为妇联主席，村负责计划生育工作和妇女工作的干部称为妇联主任。
