菜豆根系发达，主根不明显，侧根与主根粗细相当。再生能力差。根系主要密集于30厘米土层内，深达100厘米，横展半径可达80厘米以上，根瘤菌发生较晚，数量较少。
菜豆的茎分蔓生、半蔓生和矮生3种类型。茎具攀缘特性，生长期需要搭架。叶分子叶、基生叶、真叶3种。子叶飞大，是发芽的主要营养来源，基生叶为单叶，对生，心脏形，真叶为三出羽状复叶。
菜豆的花为总状花序，着生2～8朵花，花蝶形，龙骨瓣螺旋状，二体雄蕊，花梗发生于叶间或茎顶端，矮生种上部花序先开放，全株花期约20天；蔓生种自下而上渐次开放，全株花期约35天，同一花序基部花先开，渐至先端。菜豆的果实为荚果，荚长8～25厘米，成熟后果荚变硬。一般开花后15天左右可采收嫩荚，25天左右果荚完全成熟可留种。每个果荚内有种子6～12粒，种子无胚乳，子叶肥大，千粒重300～600克，最小仅100克。最大达800克，种子寿命2～3年。
