菠萝蜜实生苗种植后3~5年开花结果，而嫁接苗则1.5年左右就可开花结果。菠萝蜜植株在生长发育过程需肥量较大，而且需要氮、磷、钾等各种营养元素的供应。因此，必须根据其不同的生长发育阶段，合理施用花前肥、壮果肥、果后肥等，以满足其生长需要，促进新捎生长、花芽分化和果实发育，并保持植株生势。根据菠萝蜜开花结果的物候期（以海南物候期为例），对结果树（即成龄树）施用氮、磷、钾肥，并与有机肥搭配施用，每个结果周期施肥3~4次。具体施用时间与用量如下：
一、施花前肥
在菠萝蜜冬春发芽、抽花序前施肥，以促进新梢生长与开花结果。一般在以月中下旬施用，每株施尿素0.5冲千克、氯化钾0.5千克或复合肥1~1.5千克。
二、施壮果肥
在菠萝蜜果实迅速增长的时期施保果肥，以促进果实的生长发育。在海南的2~4月份，为菠萝蜜果实迅速膨大的时期，而此时正值海南干旱季节，故必须进行灌溉，施肥，保花保果，提高产量。一般在翌年3、4月前后施用，每株施尿素0.5千克、氯化钾1~1.5千克、过磷酸钙0.5千克、饼肥2~3千克。
三、施果后肥
施养树肥是菠萝蜜稳产的一项重要技术，施好养树肥能及时给植株补充养分，以保持或恢复植株生势，避免植株因结果多、养分不足而衰退。在采收菠萝蜜果实后，要及时重施有机肥和施少量化肥。一般在7月中下旬施用，每株施有机肥25~30千克、饼肥2~3千克（与有机肥混堆）、复合肥1~1.5千克。
菠萝蜜的施肥方法应根据树龄、肥料种类、土壤类型等来决定。适宜的施肥方法可以减少肥害，提高肥料利用率。
在生产中，施肥方法有环沟施或穴施等。施肥时，在株间或行间的树冠外围挖条形沟施下，施肥沟的深浅依肥料种类、施用量而异。一般施肥沟宽、深为15~20厘米；沟长约100厚米。旱季施化肥要结合灌水，有机肥施用应结合深翻扩穴深施。
