1、在发酵菌糠时一定要将物料压实密封，密封好不开封的情况下发酵料可以保存半年以上不变质。密封效果不好会导致发酵料表面霉变，饲喂时要铲除表面霉变的发酵料。
2、发酵料如果酸度过大，动物适口性差时可以在发酵后添加1-2%小苏打中和发酵料的酸度，改善动物适口性。
3、发酵料开封进行饲喂后，建议7天内使用完，每次取料后要注意继续进行密封保存。
4、发酵料由于营养比较单一，建议在饲喂前添加对应动物的全价饲料或适当的能量饲料和蛋白饲料、预混料来调节营养配比，使动物达到更佳的饲喂效果和生长速度。
5、动物第一次饲喂发酵料必须遵循先少量饲喂然后逐步加量的原则，一般小动物最大使用量10%-20%，中等动物20%-30%，大动物30%-40%。在实际饲养中行适当的调整。
6、第一次使用发酵饲料可能会出现零星或者短时间的腹泻，这些都属于正常的现象。可以通过减少发酵料和添加药物进行调整。连续使用发酵料一周后会发现动物的消化率大大的提高，粪便变松软而且量变少，栏舍的氨臭味大大的减低。
