圆珠笔与水笔不同之处就在于，它使用的是干稠性油墨，油墨又是依靠笔头上自由转动的钢珠带出来转写到纸上，因此不渗漏、不受气侯影响，并且书写时间较长，省去了需经常灌注墨水的麻烦。圆珠笔又称为油性笔，笔芯使用的油墨为油性，难溶于水，不易褪色和化开，油性笔可在吸收面和非吸收面上书写，且不易被擦去，在白纸上书写，背面上有明显的背痕。而且书写手感与书写质量不佳。
水笔指的是水性圆珠笔，水性笔的优点是颜料多为纤维笔头，不易干涩，毛细管结构使得出水流畅快干，书写顺滑而稳定。写出来的字好多年都不会褪色，所以非常适合签字用。但水笔也是有缺点的，水笔墨水大多不防水，不耐日晒，不适合长久保存
