余姓起源有三：
1 、据《风俗通》载，余姓为“由余之后，世居歙州，为新安大族，望出下邳、吴兴”。春秋时，秦国有个臣医叫由余，他的祖先是晋人，避乱于西戎。由余本来在西戎为官，后奉命出使秦国，见秦穆公贤德大度，就留在秦国为臣。他为穆公谋划征伐西戎，使秦国成为西方霸主。他的后代子孙以其名字为姓，有的姓由，有的姓余， 同出一宗。
2、 出自赤狄族，为隗姓之后。据《国语》载，“潞、洛、泉、余、满五姓，皆赤狄隗姓。”
3、 系铁木复姓所改，为元太祖成吉思汗（铁木真）的后代，出自铁穆氏宰相之家。相传铁穆宰相乃是忠臣，太祖听信谗言，要捉拿铁穆宰相的五个儿子。五子星夜出城，逃至贵州，见太祖亲领追兵前来，就躲在凤锦桥下。追兵到来时，有人见桥下水波动荡，提出可疑，太祖未加细查，随口说：“江中有水，水中有鱼，何必大惊小怪，快快继续向前追赶。”铁穆氏五兄弟逃脱后，原想改铁穆氏为金氏，最后决定改为余氏。“余”比金字少一横，又是“水中有鱼”的鱼字的谐音，堪称一字双关。
姓氏分布
历史上，余氏基本上是一个较典型的南方姓氏。余氏最早的发祥地应在今陕西凤翔至咸阳一带具体播迁情况因缺乏资料，故难以详考。大致上讲，余姓于汉时迁入安徽的歙县一带，并落籍此地繁衍发展。汉以后，我国南方北方的余姓基本上都在繁衍，但北方要弱得多。余姓有不少迁居浙江、江苏、江西等地。魏晋南北朝时，余姓已成为新安郡一带的望族。又由于北方战乱，余姓南迁不可避免，部分余姓族人迁入湖南、湖北。唐代以后，余姓才迅速壮大起来，并形成东南一带两处望族。余姓迁入福建、广东等地，始于唐末宋时。明清之际，余姓不仅已遍布江南各地，而且北方各地的余姓也得到了迅速的发展。
