1）行政级别不同
铁道部拆分后，分成中国铁路总公司和国家铁路局，前者为正部级单位；而后者并入交通部，为副部级单位。
2）管辖范围不同
铁总下属管辖着18个铁路局，日常称呼中常见的各个铁路局，比如北京铁路局、上海铁路局、武汉铁路局、广铁集团等，都是铁总的下属单位；而国家铁路局只是一个行政机构，没有其下属的管辖单位。
3）存在形式不同
铁总以央企性质存在，归国务院管理；国家铁路局以政府机构形式存在，并隶属于交通部管理。
4）职权不同
目前来看，国家铁路局职权比较虚，只是相当于一个政府机构，国家铁路局在更多层次上只是起到一个监管作用，而这种监管能到什么程度自然是仁者见仁；而铁总才是享有制定运输政策、确定经营方向的权力的主体机构。
