来源不同、用途不同。
一、木薯粉是一种从热带植物木薯的块根中提取的淀粉，木薯粉不能生吃，因为它里面含有氢氰酸，是一种天然的毒素，它遇到七十度以上的高温会消失，因此食用木薯粉必须要做熟以后才能吃，马铃薯淀粉是由土豆中提取的淀粉，并没有天然的毒素存在，既使生吃，也不会有中毒的情况发生。
二、木薯粉在遇热以后会变成透明状，有一定的韧性，可以用于多种食品的加工，而马铃薯淀粉在生活中多会被当成一种调味品，炒菜或者做汤时，淀粉都会起到收汁作用，在炸制一些食品时，也可以把马铃薯淀粉包裹在食材外层上，会让炸出的食品更加松脆。
拓展资料
1.木薯淀粉可制酒精、果糖、葡萄糖、麦芽糖、味精、啤酒、面包、饼干、虾片、粉丝、酱料以及塑料纤维塑料薄膜、树脂、涂料、胶粘剂等化工产品。
2.马铃薯淀粉作为一种良好的增稠剂，被广泛地使用在酱料类食品中，使用变性淀粉可降低生产成本；同时，由于酱料品质稳定，可长时间存放不分层，使得产品外观有光泽且口感细腻。
