关于朱允炆的结局结局目前主要有三种说法：
其一，是与他的皇后一起被烧死在皇宫中。当时燕王朱棣发动靖难之役，攻入皇宫，宫中燃气熊熊大火，烧死了无数宫女宦官，连皇后都不能幸免，因此很多人相信建文帝朱允炆也不能例外。但是由于尸体被烧焦，无法辨认，再加上与建文帝亲近的太监指认被烧焦的尸体中没有建文帝朱允炆，而他究竟有没有葬身火海，当时人便议论纷纷，一时谣言四起。
其二，是朱允炆没有死，而是在亲信的护卫下逃过一劫，流落到东南亚一带了。这种说法的主要依据是朱棣登上皇位后，不惜耗费国力几次派郑和下西洋就是为了寻找建文帝朱允炆的下落。因为朱棣这个皇位名不正言不顺，再加上当时有很多同情朱允炆的人，于是朱棣怕这些人一旦找到朱允炆便会揭竿而起，威胁自己，因此要抢先找到他。
其三，是有人说朱允炆是从皇宫密道逃出出家当和尚了，因为当时有很多和尚自称是建文帝，弄得朱棣寝食难安，而且出家为僧，躲藏起来，的确是逃避灾祸的手段之一
