秘籍和秘笈的区别是：指代不同、引证用法不同、侧重点不同。
一、指代不同
1、秘籍：珍贵罕见的书籍或非一般人能理解的书籍，如武功秘籍。
2、秘笈：秘笈，又称秘籍、密技。
二、引证用法不同
1、秘籍：龚自珍 《小游仙词》：“秘籍何人领九流，一编《鸿寳》枕中抽。”
2、秘笈：《新唐书·段成式传》：“博学彊记，多奇篇秘籍。”
三、侧重点不同
1、秘籍：在中国的武侠小说里，有数量众多的武功秘籍，如战神图录，天魔策，长生诀，九阴真经，九阳真经，易筋经，葵花宝典等等。所以从武侠小说的范畴来看，秘籍就是武功秘籍。
秘籍是中国古代神秘事物的一种体现方式，古代帝王想要得到长生之术，一些江湖术士纷纷投其所好，炼制丹药，并将炼制丹药的配方称为"秘方"，即"不可以告诉别人的书籍"的意思，它是一种传承的方式。
2、秘笈：秘笈不同于其他公开的信息文字物件，有一定的非公开性和实用价值。是干某件事情的重要方法、诀窍。
