1、颜色不同
这是最直观的，一个是红色，一个是青色，最近很受欢迎的藤椒就属于青花椒。
2、味道不同
两种花椒都具有浓烈的味道，不过味道却有所不同。红花椒的香味更浓郁，属于浓香微麻。而青花椒的香味比较淡，麻味比较重，属于浓麻微香。
3、用法不同
因为两种花椒的味道不同，所以使用的方法也不同。
红花椒——香味比较浓郁，所以它的主要作用是去腥增香，比如在腌制肉类、鱼类时，加入适量花椒能够有效去腥。在拌饺子馅时，通常也会加入适量花椒水，也有去腥的作用。炒菜爆锅时，加入花椒能够有效提香，炸花椒也用红花椒，一般香辣味的菜肴用的都是红花椒。
青花椒——青花椒的麻味更重，所以在突出麻味的菜肴中经常使用，比如椒麻鸡、椒麻鱼等。在腌制泡菜时，加入适量青花椒会别具风味，又麻又香，让泡菜的酸味更加浓郁。同时，青花椒能消毒杀菌，防止泡菜滋生细菌，不生花（不起白泡）。
