汉初，今合浦县境属南越国辖地。元鼎六年（公元前111年），汉武帝平南越，划出南海、象郡交界地方置合浦郡，郡治徐闻（今广东省海康县地域），同时设合浦县。合浦县辖地为今合浦、浦北、北海、灵山、钦州、博白、廉江、容县、北流以及邕宁、横县的一部分。
三国汉献帝建安十五年（公元210年），孙权派步骘任交州刺史，合浦属孙吴辖地。吴黄武五年（226年），分合浦以北归广州管辖，黄武七年（228年），合浦郡改称珠官郡，同年划分出合浦县南境设置珠官县，与合浦县同属珠官郡。
吴太元二年至太平三年（252年一258年）复称合浦郡。吴永安三年（260年），划出合浦县西北部设置昌平县（今横县），隶属合浦郡。
西晋太康元年（281年），撤珠崖郡并入合浦郡，同年划出合浦县东北部设荡昌县（今容县），建武元年（317年）以后，又析合浦县地置新安县。合浦郡隶属交州，郡址在合浦县城（今浦北县旧州）。
中华民国元年（1912年），撤销廉州府。合浦县直属钦廉军政府辖。同年钦
解放后，1949年合浦县隶属广东省南路专区。
1949年合浦县隶属广东省南路专区。1950年合浦县改属广东省钦廉专区。1951年合浦县隶属广东省钦州专区，同年5月10日将合浦县辖的东镇、西镇、高德乡、涠洲乡设北海市。1952年合浦县隶属广西省钦州专区。
同年5月31日将合浦县北部析置浦北县。1953年钦州专署迁合浦县廉州镇。1955年钦州专区划归广东省，改称合浦专区，合浦县属合浦专区。1958年撤销合浦专区，将所属县市并入广东省湛江专区。合浦县属湛江专区，同时将北海市和浦北县并归合浦县。
1959年6月设北海镇（县级），1965年复设浦北县，同属广西壮族自治区钦州专区。1970年钦州专区改称钦州地区，合浦县属钦州地区。1987年7月合浦县划归北海市管辖。1994年12月，划出南康镇、营盘镇设立北海市铁山港区，划出福成镇归北海市银海区管辖。
