交配品种不同
1、二元猪：两个品种之间的杂交或品系杂交得来杂交品种。（指长白公猪将大白母猪杂交而成的品种）。
2、三元猪：由三个品种的杂交猪，是将两品种杂交而得到的一代杂交母猪再与第二个品种进行杂交得来的。（在二元猪优良的基础上再与其他品种进行杂交而得到猪）。
杂交效果不同
1、二元猪：杂合程度较大，杂交优势明显，长势较快，育肥效果好，应用较广泛，对于养殖技术的要求较低。
2、三元猪：充分利用杂交优势，提高瘦肉率，解决原种母猪不足的矛盾，对于养殖技术要求高。三元杂交猪主要是结合二元猪杂交猪的优点和终端父本的优点，生长速度较快。
