区别在于：
一、分布不同
1、漳港蚌：分布在沿海地区，生活在浅海底。
2、贵妃蚌：分布于亚洲、欧洲、北美和北非的淡水湖泊、河流、池塘中。
二、贝壳不同
1、漳港蚌：左右两壳相等。壳顶尖，略向前屈，位于贝壳背缘中部稍向前端。壳面中部膨胀，向前、后及近腹缘急剧收缩，致前、后缘多少形成肋状，小月面和楯面心脏形。壳面生长纹明显粗大，形成凹凸不平的同心环纹。
2、贵妃蚌：贝壳很厚，两个贝壳在背面相接合的部分有齿，壳的珍珠层较厚。
三、纲目科不同
1、漳港蚌：属于双壳纲帘蛤目马珂蛤科
2、贵妃蚌：属于双壳纲蚌目珠蚌科
