1 结果直观：可以直接通过突变体和野生型之间的表型不同，研究基因功能。为后续研究提供基础；
2 来源简便：目前国际上有很多突变体库，可以直接购买；
3 根源基因：可以通过突变体与野生型基因组的区别，或者突变发生位点的基因，直接找到与表型相关的基因，从而对该基因进行研究；
4 避免基因获得的缺点：有一些基因，即使使用过表达的方法，也没有表型，或者在基因过表达的时候造成不育或者致死，无法得到转基因后代的情况下，使用突变体可以直接研究该基因功能；
5 基因互补：将外源的基因，转入植物突变体中，如果能够获得表型的回复突变，那么同样可以证明该基因的功能。
