轮藻植物由于所含色素及光合作用形成的产物与绿藻门的藻类相似，有的学者将它归入绿藻门的一个纲。
但由于其营养体的构造和生殖器官与繁殖方式都较为复杂，与绿藻区别较大，所以有些学者把它单独列为一门，即轮藻门。轮藻植物在进化分类系统中有特殊的地位，常被认为是由藻类植物演化为苔藓植物的中间过渡类型。
在植物细胞学和生理学的研究上，轮藻植物至今仍作为重要的实验材料而被利用。除此之外，轮藻植物近数十年中也被利用作为肥料、灭蛟虫、医疗疾病、水质监测和地质勘探等方面。
轮藻植物多生于淡水，少数种类分布于咸水湖或海滨半咸水的浅水区。植物体有类似根、茎、叶的分化，外形很像水生高等植物中的金鱼藻，中国俗称为水茴香或丝草。
