故事开头行星表面下，轰隆声逐渐变大，然后庞大的西斯舰队和星际驱逐舰从黑暗中出现，舰队逐渐从行星的地下，升到空中，一股未知而庞大的黑暗力量，从黑暗中诞生……。第一秩序的最高领袖凯洛·伦意识到这股未知而庞大的黑暗力量，亲自领导第一秩序对一个星球发动袭击和地面式搜索，对这个星球展开了惨无人道的大屠杀，目的是找到藏在这个星球上，属于黑暗力量的搜索定位装置，最后找到了现在藏在一名先知手上的搜索装置，一个锥体形的坐标仪。
莱娅公主，抵抗组织的将军，在绝地武士卢克·天行者死后，一直在帮助女主训练，学习使用原力。在抵抗组织的帮助下，原本断裂的属于卢克的光剑修复完整，女主第一次开启修复好的光剑。
女主一直希望自己在使用原力上有所进步，在训练没有进步时，女主懊恼地扔出一把光剑，将一棵树砍倒而砸中身边的机器人BB-8。凯洛驾驶战机穿过红色星云，抵达未知星系后，降落在一块巨大的立方体前登陆，电梯向下降落时，凯洛察觉到许多巨大的雕像。凯洛随着电梯到达最深层，这里看起来更像是一个实验场所。《星战9》一开始隐藏已久的终极大反派现身，他同样也是整个星战系列最大的boss前银河帝国皇帝，正是在此重建银河帝国的黑暗势力。皇帝将黑暗计划全盘托出，只要凯洛答应他杀掉女主，就能拥有成千上万歼星舰的指挥权，这支舰队名叫“最后军团”。
另一方面，女主的朋友们正前往一个冰雪覆盖的星球所在的小行星基地，与一位和第一秩序有密切关联的卧底见面。与此同时，第一秩序的部队到达小行星基地前，组织进攻基地。攻击的火力和部队突然杀到，小黑和小帅立刻进行超光速飞行逃离。但是超光速飞行前没有提前设定目的地，会导致超光速飞船撞得粉碎。虽然没有设定目的地，千年隼号也受到了攻击，但是依旧幸运地躲过了第一秩序战斗机的追击。小帅重新设定导航目的地，位于密林中的抵抗组织基地，带着情报信息出发返航。
小黑和小帅将间谍的情报交给莱娅，抵抗组织的情报工作人员解密信息，莱娅公主和众人知道了莱娅公主的儿子，第一秩序的最高领袖，凯洛·伦正在未知领域，同时还知晓了银河帝国黑暗势力皇帝的存在。当反抗军得知帝国皇帝还活着时，女主便和好友们启程展开冒险，目的是拿到一个指明最后军团驻扎的坐标仪。
原力联结使得凯洛能看到女主，凯洛一直在诱惑女主，甚至能直接摸到女主脖子上的项链，女主立刻中断原力联结。凯洛在摸到项链的瞬间，目的是让第一秩序通过女主身上的线索，找到女主一行人的所在地。一行人通过路行艇离开，但是立刻被第一秩序的战斗机追杀。
女主一行人消灭了不少追兵，但是被最后的一个士兵撞上了路行艇。路行艇失控将全部人抛向有流沙的地面，流沙迅速将众人都吸了进去。众人顺着流沙滑落到地底下，找到了此行目标一把重要的匕首……匕首上，写满了无人能理解的文字。即使是精通文字和语言翻译的机器人也无法识别上面的文字。
在出口处有一条巨蛇似乎受伤了，女主试图做些什么，随后奇迹发生了，爬虫的伤口开始愈合，恢复过来后就逃走了。但众人没有意识到，危机已经到来，第一秩序的星际驱逐舰和凯洛已经找到众人所在位置。女主意识到凯洛正在着急寻找她，为了众人的安全，女主打算独自面对凯洛为其他人争取时间逃跑。女主独自面对驾驶着拦截者战机的凯洛，当战机飞过来时，女主开启光剑，和战机同方向奔跑，在战机即将靠近自己的瞬间腾空跃起。女主在空中砍掉了战机的机翼，战机失控坠毁。凯洛则试图将飞船推到远处，女主与凯洛二人一拉一推，互不相让。凯洛逐渐取得上风，激起了女主的斗志，女主在愤怒中，释放了“闪电”，击中刚刚离开地面的飞船，飞船炸的粉碎，杀死了飞船上的所有人……
阿丘被抓，一行人启程白雪覆盖的冰冻星球，准备解开匕首上的秘密，匕首文字翻译显示一个和皇帝有关的坐标，一个引路器的位置。凯洛和第一秩序的星际驱逐舰来到女主所在的星球，女主三人潜入星际驱逐舰，救走阿丘。因为搜寻女主无果，凯洛就开始和女主进行原力联结。
凯洛立刻意识到女主就在星际驱逐舰上，在原力联结的同时二人在不同的两处通过原力联结进行了光剑决斗。期间女主终于知晓了她的身世，原来女主是皇帝的孙女，所以她拥有和皇帝一样的超强黑暗原力，之后他们继续前行，去到一个日常海啸的星球，那里有着死星的残骸，坐标器就在里面，在那里女主和凯洛展开了光剑对决。女主和凯洛海上的光剑对决，更是让人看了热血沸腾，周围海啸酝酿着角色的情绪和心境，海水拍成浪花挥舞着光剑，让人感受到了对决的能量。女主与凯洛战斗继续时，二人都感觉到了莱娅的死亡，对凯洛而言是一个母亲，对女主而言是一个导师。
二人从莱娅的死亡中反应过来，女主先于凯洛一步，夺走了凯洛的光剑，并用光剑击穿凯洛的身体。女主收手，告诫凯洛她永远不会像凯洛一样堕落。然后，女主施展了她的新能力，将凯洛从重伤中恢复过来。女主开走了凯洛的战机，带走了维达的引路器，留下凯洛一个人。被击败的凯洛依旧在死星二号的残骸上，看到了父亲韩索罗的幻象，父亲告诫儿子，做出正确的选择，即使再晚回到光明面也不迟。
女主前往了绝地武士的起源地，女主决定效仿卢克，自我放逐，远离一切，从此隐居。但这时卢克英灵适时的出现，鼓舞女主，但语气严肃，面对黑暗不是一件容易的事，面对皇帝更是异常困难，卢克说到，最重要的，不是你的遗传，而是你的内心。女主被卢克重新激励，完成之前认为自己无法完成的使命，面对皇帝，女主决定离开这座小岛。
于是女主整装出发，前往皇帝的老巢，向抵抗组织传送了皇帝的坐标，抵抗组织全员准备出动，共同迎战皇帝和银河帝国……抵抗组织的全部军事力量抵达，和皇帝的银河帝国星际驱逐舰开始激战。抵抗组织的计划是摧毁星际驱逐舰的控制塔，使得被破坏的驱逐舰失控指挥和控制。但抵抗组织没有意料的是，控制塔信号转移到了星际指挥舰上，唯有摧毁总指挥中心才能彻底打败第一秩序和银河帝国的战事部署，任务变得十分艰巨。在抵抗组织损失惨重的情况下，援军及时到来对抗第一秩序和银河帝国。战事拖得越久，对于抵抗组织越是不利，逐渐变成持久战反而对军事资源占优的第一秩序和银河帝国更加有利……
画面一转，女主深受重伤躺在地上，困难地保持专注，女主寻求原力的帮助，和过去的绝地武士产生原力联结，女主听到了无数绝地武士的声音，而最后听到了卢克和莱娅的声音。皇帝愤怒地将全部的闪电射出，在击中女主的瞬间，女主开启光剑对抗闪电。
两把光剑共同抵御皇帝的闪电攻击，在两把光剑和更多的绝地武士支持下，一点一点扭转局势，女主将闪电挡开，闪电反射击中了皇帝，皇帝被瞬间杀死，最后一个西斯死亡，帕尔帕廷被自己的力量击中产生爆炸，皇帝解体所释放出的能量导致巨大雕像和整个建筑的崩坍
抵抗组织看到女主击败了皇帝而受到鼓舞，而皇帝的死亡导致第一组织和银河帝国群龙无首，士气受挫。指挥信号随着战舰一同被摧毁，其他失去控制的战舰甚至将炮火对准其他战舰，互相碰撞，产生连锁效应，整个星际驱逐舰战队，第一组织以及银河帝国就此毁灭。
