筛选差异基因常用的方法是滤波法和统计学方法。以下是一般的分析流程：
1. 去除低表达基因：将低表达基因过滤掉，防止由于表达量太低造成误判。
2. 标准化：使用一种标准化方法（例如TMM或RPKM）将数据转换为相对表达值，以便进行后续统计学分析。
3. 统计学方法：使用统计学方法（例如DESeq2或edgeR）进行差异基因筛选。这些方法可以从转录组数据中检测出表达量差异的基因，并根据显著性水平进行排名。
4. 阈值设定：根据显著性水平、折叠变化、FDR等指标设置阈值，将差异表达的基因筛选出来。
5. 功能注释：对筛选出的基因进行功能注释，进一步验证它们的生物学意义。
