蒙古族所崇拜的图腾有狼图腾、鹿图腾、熊图腾、鹰图腾、树木图腾等。图腾崇拜是将某种动物或植物等特定物体视作与本氏族有亲属或其他特殊关系的崇拜行为，是原始宗教的最初形式。具体介绍如下：
1、狼图腾：狼是突厥系民族图腾，阿尔泰民族的另一支东胡也敬畏狼。汉史载古代突厥系民族高车认为他们是一个美丽匈奴公主和一匹狼的后代。而乌孙的祖先则传说是弃婴和母狼阿史那的后代。乌孙、高车，一为匈奴养子，一为匈奴之后，加之传为匈奴别部的突厥，皆有狼祖神话。
2、鹿图腾：蒙古萨满认为鹿能显灵，可以驱魔镇邪。内蒙古巴尔虎、察哈尔、科尔沁等地区萨满巫师所戴的帽子都用铁皮制成鹿角加以装饰，所用的青铜镜和法鼓也都刻画着鹿的形象，说明蒙古先民、特别是森林狩猎民曾以鹿为图腾神灵。
3、熊图腾：布里亚特和达尔哈特人常用崇拜熊，将其看成是猛兽之王。在猎熊时，他们要遵循从古以来传承的"熊祭仪"，举行许多奇特的祭祀仪式。则熊与妇女相交生子的神化传说，反映了古人希望能像那样凶猛，甚至幻想变成熊，表现了人类早期“恐惧创造神”的特征。
4、由于萨满是由神鹰孕化而来，所以鹰便成了萨满始祖灵的象征物。科尔沁右翼杜尔伯特乌尔图那苏贝是成吉思汗弟弟哈萨尔的第二十七世孙，他们的氏族自称是鹰氏族，各代的长子、长孙都以各种鹰来命名。
5、树木图腾：从蒙古人的树木崇拜来看，无论神话传说还是蒙古英雄史诗中所残留的树木崇拜观念在植物崇拜中却具有相当广泛的代表性。北方各民族的狩猎民自古栖居山林，靠山林哺育成长，发展壮大，蒙古族亦然，开始以山林做摇篮，之后向草原推进。
