1、外形不同：河鳗体形相对比较细长，头中等大，眼睛较小，嘴尖而扁，有鱼鳞，但是比较小且埋于皮下，呈纹席状排列，胸鳍比海鳗小而圆，外形基本上是灰黑色，腹部为白色；而海鳗头部比河鳗尖而长，嘴巴和眼睛较大，外形上没有鱼鳞，并且有侧线，胸鳍较为宽大，外形多为黄色，伴有黑斑点，腹部呈灰白色。
2、价格不同：河鳗一般市面上的鳗鱼大概20-30元一斤，另外野生的鳗鱼就100多元一斤；海鳗的品种不同，价格同样也有浮动，鲜海鳗15-16元一斤，干海鳗24-25元一斤，深海小海鳗14元左右。
3、分布区域不同：河鳗生长在咸淡水交界的地方，主要分布在中国长江、珠江流域、闽江、海南岛及江河湖泊中，属于淡水鱼；海鳗主要分布于长江口近海水域，属于暖水性近底层鱼类，具有广温性海鳗以及广盐性海鳗。
