种苗难以选择,目前黄鳝人工繁育种苗还处于探索阶段。技术难以解决,黄鳝养殖没有形成规模,没有系统的技术理论,多数养殖户都是在摸着石头过河。
环境意识不强,黄鳝养殖对环境要求特别高,不少养殖户却对环境极不重视,导致黄鳝苗容易发病死亡。苗种较差：在购苗鳝种时，一般是以野外的鳝种为主。但是，要注意观察鳝种的外观来保证品质，一般品质好的黄鳝体表上有着较大的斑块，颜色以深黄与大红为主。在运输的时候，要注意做好储存工作，防止受伤降低成活率。
2、水位过深：黄鳝体内没有鱼鳔，不会在水表层内随便的漂浮。如果水位过深，黄鳝呼吸受阻，要经常到水面上进行呼吸。这样对体能消耗非常大，不利于黄鳝生长。因此，要注意控制水位，最深不可超过20厘米，保持在10-15厘米左右。如果是网箱养殖，要种植适量水草。
3、管理不当：如果养殖黄鳝将不同规格的黄鳝放在一起，小黄鳝会因为吃不到食，导致营养不足，体质下降，甚至死亡。如果饲料不足，还会出现大吃小的现象。还有些养殖户为了提高水质的肥力，会不加限制的在水中施入农家肥。由于水体过小，水质极易变差，引发各种疾病。
4、饲喂不当：投喂饲料要保证饲料的稳定性，不能经常更换饲料且突然更换。否则黄鳝无法及时适应，会出现拒绝进食现象，生长发育就会受阻。但是，也不能长期的饲喂单一饲料，尤其是麦麸、豆渣等素食饲料。虽然黄鳝会吃，但是不能够满足黄鳝生长所需要的营养，导致黄鳝不仅无法增重，还会逐渐死亡。
