一、内容不同
1、全文数据库：以期刊论文、会议论文、政府出版物、研究报告、法律条文和案例、商业信息等为主。
2、文献数据库：计算机可读的、有组织的相关文献信息的集合。
二、结构特点不同
1、全文数据库：全文数据库免去了文献标引著录等加工环节，减少了数据组织中的人为因素，因此数据更新速度快，检索结果查准率更高；同时由于直接提供全文，省去了找到原文的麻烦，因此深受用户喜爱。
2、文献数据库：在文献数据库中，文献信息不是以传统的文字，而是将文字用二进制编码的方式表示,按一定的数据结构,有组织地存储在计算机中，从而使计算机能够识别和处理。
