2006年12月，上海交大接到对陈进等人涉嫌造假的举报后十分重视，立即对有关情况进行了初步调查。考虑到问题的严肃性和复杂性，上海交大随即请求国家权威部门对事件进行深入全面调查。
科技部根据专家调查组的调查结论和国家科技计划管理有关规定，决定终止陈进负责的科研项目的执行，追缴相关经费，取消陈进以后承担国家科技计划课题的资格；教育部决定取消其享受政府特殊津贴的资格，追缴相应拨款；
国家发改委决定终止陈进负责的高技术产业化项目的执行，追缴相关经费。上海交大按照学校有关规定和程序，经研究决定：撤销陈进上海交大微电子学院院长职务；撤销陈进的教授职务任职资格，解除其教授聘用合同。
