在AgitΩ的故事发生约半年前，在濑户内海航行的“天亮号”的乘客发现船舱内突然出现一名白衣青年(尸体)。而后遭遇到怪异的暴风雨袭击。突然白衣青年再次出现并将自己的力量赐予了沢木 哲也，而众人也被其光芒照射到。事毕，一个神秘的光球闯入，水天使出现在众人面前欲杀死得到AGITO之力的哲也。在甲板上，哲也第一次变身成为了AgitΩ。AgitΩ不敌，落入海中。水天使知道其余的乘客终有一天也会进化为AgitΩ，但他的任务是消灭AgitΩ，遂放过众人并警告众人不得将秘密告诉他人。
与此同时，巡警冰川 诚发现这一气象异变独自驾船前去营救，凭一人之力救得众人(同时，海上警视厅因为要应对迎接重要人物，且对警报抱着怀疑态度而没有发出巡逻艇)。
被救出的乘客，后来除了少数发生了精神障碍的情况，大部分的乘客却似乎被引发了潜能，而成为了超能力者。而这些拥有「力量」者，自然也成为Unknown所要加以杀害的对象。船上的乘客有：三浦智子（9集死亡）﹑凉的父亲（10集死亡）﹑筱原 佐惠子（12集死亡）﹑榊亚纪（21集死亡）﹑关谷 真澄（32集死亡）﹑相良 克彦（31集死亡）﹑真岛 浩二（31集登场，39集为了救凉舍弃了AgitΩ的力量变成了普通人）、橘 纯（32集死亡）、木野 熏（46集死亡）等。而这些超能力者中，其他乘客都以木野 熏为首，寻找着一份安全感。除木野 熏已经力量「觉醒」外，亚纪﹑真澄和克彦等都在接触过AgitΩ后有(真)翔一的「启发」下，让自己的超能力「觉醒」了过来！ 真名：沢木哲也/泽木哲也。本身是料理专科学校的学生。在得悉姐姐自杀后欲前往东京找姐姐的男友一问究竟便坐上了“天亮号”。被打入海中后，幸运的在濑户内海某处海滨被三名女中学生。由于他的身上没有其它能够证明其身份的物品，只好先以身上所携之信封的收信人--「津上翔一」来称呼他。这也就是本篇主角「津上翔一」名字的由来。而醒来的翔一，由于丧失记忆之故，暂时借住在美杉义彦教授的家中，成了食客二号、佣人。翔一拥有感知Unknown及变身成AgitΩ的能力，然而对于如何拥有这样的能力，自己本人却完全不知所以然。在第43话完全恢复记忆。虽然开始反对人家叫他翔一，但没人愿意改口。
真正叫津上 翔一的人是剧中跟暗之神接触的那名男子，即沢木 哲也姐姐沢木 雪菜的男友，在沢木 雪莱受不了Agito的力量而试图跳楼自杀时，津上 翔一拉住了雪菜，最后又在雪菜的哀求下松开了手，随即津上翔一便成为了杀死第一个AgitΩ的人类，其实他早就死了一次，但暗之力为了创造毁灭AgitΩ的使者，暗之力选中了他并让他复活，想让他帮助暗之力消灭AgitΩ。但是翔一背叛了黑神，泽木 哲也与Unkown战斗中快被杀死时，津上翔一骗了暗之力，让AgitΩ的Machine Tornador有了滑翔模式，使得AgitΩ成功击败了Unkown。在后来的剧情中，津上翔一多次帮助AgitΩ，两次让Gills死而复生（一次死亡，一次重伤快死），加速超能力者的进化，并说过“我的双手是用来保护人类的……”。在最后的一集中，生命衰竭的津上翔一与暗之力打赌，也成功阻止了黑神毁灭人类的想法。
