1、形状
玉髓和玛瑙的形状是不同的，天然玉髓常以乳状或者钟乳状产出，也有的呈肾状、葡萄状等形态，而玛瑙常以致密的块状或者片状产出，也有一些是呈葡萄状、结核状等形态。
2、纹理
此外它们的纹理也是大不相同，玉髓属于微晶质结构，表面上很少会有条状纹理，表面呈现的是玻璃光泽或者油脂光泽，而玛瑙属于脱水二氧化硅的胶凝体结构，常有条状或者片状的纹路出现，一般是以玻璃光泽居多。
3、净度
同时两者的净度也是不同的，玉髓的透明度很高，内部中很少会有杂质，整体看起来比较通透，相比之下，玛瑙的净度要差一些，内部中常有一些包裹体出现，看起来比较明亮。
