事业单位自筹在编和不在编区别太大了，好比正式工与临时工一样。
而事业单位自筹与纯事业也有所不同，纯事业是全额财政拨款，而事业单位自筹，是完全靠自身单位业务，经营挣钱发工资福利。
因此有以下不同点：
（一）概念不同：
1.不管是事业单位在编还是自筹，只要是事业单位在编人员，就是正式员工。
2.事业单位不在编：事业单位不在编就是本单位自行外聘的人员，由单位自行规定其待遇，发放工资，与地方财政无关。
（二）福利不同：
1.事业单位在编：你的待遇享受事业单位在编员工完全享受机构的福利政策。
2.事业单位不在编：事业单位不在编人员的绩效工资，住房公积金，住房公积金补贴等比在编人员差一点，只能享受事业单位的部分福利。
（三）晋升途径不同：
1.事业单位在编：有编制的话属于正式员工，根据工龄、能力（社会背景）可以进职称，也可以有其它升职的途径。
2.事业单位不在编：没有编制的话你干几年都是普通科员，原则上不在事业单位晋升范围内。
（四）合同不同：
1.事业单位在编：在编的员工很多都是长期合同或无固定期限合同，由用人机构直接签署。
2.事业单位不在编：不在编的员工合同多为派遣公司代理，也就是所谓的劳务输出，就算是用人机构签订合同，也是短期合同。
（五）在单位地位不同：
1.事业单位在编：有编制的员工有投票权，在竞争上岗、年终互评的时候能发表下意见，日常工作量也不会太大。
2.事业单位不在编：没有编制的话或许就没有投票权，因为你不做有随时走人的风险，所以没有编制的人员往往要承担较大的工作量。
