大理、祥云、云南驿、楚雄、禄丰南、昆明、昆明南、弥勒、普者黑、珠琳、广南县、富宁、百色、田东北、平果、南宁、南宁东、来宾北、柳州、桂林北、兴安北、全州南、东安东、永州、祁阳、祁东、衡阳东
D3961次列车始发站衡阳东,发车时间06:55,终到站大理站,终到时间19:54,全程运行历时12小时59分钟。
途中经停车站如下:
祁东,祁阳,永州,东安东,全州南,兴安北,桂林北,永福南,柳州,来宾北,南宁东,南宁,隆安东,平果,田东北,百色,富宁,广南县,普者黑,弥勒,昆明南,昆明,禄丰南,楚雄,南华。