车站方面并没有明确的规定，但由于车厢内并不宽敞，一般情况下是不主张乘客携带宠物上车。但如果对方一定要带宠物上车，车站方面会要求宠物主人自行准备好笼子或者纸箱，并放置在不影响其他乘客通行的地方。此外，在路途中，宠物主人也要保证宠物的各种行为不会对其他旅客产生影响。
如果选择乘坐火车是允许的：
在出发前，宠物主人应持在法定的防疫点注射疫苗后颁发的免疫证，带着宠物到法定的动物检疫机构，南京城区范围内可到位于七里街的南京市畜牧兽医站做健康检查，检查合格后，可获得检疫证明。对于笼具也需要做消毒处理，并获得消毒证明。
获得防疫证明后，宠物主人可到火车站托运部门办理自押手续，需要注意的是，这个证明的有效期最长只有7天，而且，在宠物到达目的站的时候，这个证明仍应该在有效期内。在火车开动前两个小时，将宠物带到火车站的行包托运处过秤即可。通过行李托运的方式携带宠物，宠物所需的费用根据它的重量和火车的路程而定。
