1、质量问题：港版苹果手机也有两种，在香港地区上市的苹果手机一般是正品，它的质量也有很大的保障，如果大陆地区的人购买港版苹果手机，就无法享受保修的服务。
港版苹果手机的另外一种被称为水货，它是通过走私到达香港再进行销售的，水货港版苹果手机一般都是重新组装而成的，它的质量就存在很大的问题。
2、国行苹果手机则在质量上有很大的保障，只要是在大陆地区购买的手机都享有质量的保障，是非常正规的手机，大多都享有三包服务。国行的价格相对港版的价格要高。港版苹果手机在大陆不能享受保修等服务，手机出问题需要回到香港保修。
3、网络配置不同：国行苹果手机三网通，有一些港行苹果手机不支持电信卡，港版苹果手机的在硬件上可以支持全网通，可以使用2g网络、3g网络以及4g网络。
4、手机功能有差异，国行iPhone6s比港版iPhone6s少Facetime和VOLTE功能。
5、手机配件上存在差异，港版的手机充电器为大三脚插头，国行充电器为小型二脚插头。港版苹果手机配备的是英式的插头，需要配备一个转换头或者购买一个苹果官方的充电头旅行套装来更换插头，国行苹果手机则是标配常见的两插，直接就可以使用。
如果想要选择一款价格比较便宜的苹果手机，那么港版的苹果手机当然是首选。如果需要全网通加售后服务保障，购买国行的苹果手机会比较放心。
