1、选择抗果锈性较强的品种种植
对于新建的果园，为了减少果实上果锈的发生率，建议选择诸如富士、红星、元帅等果锈情况出现少、发生程度轻的苹果品种，或者果实生锈情况中等的国光、秦冠、红玉等苹果品种，尽量避免栽种果锈发生情况较重的金冠、秦冠、国光、华冠、黄元帅等苹果品种。
除此之外，选用果皮较厚、皮质层与角质层较厚、皮下组织排列密实、果皮细胞多的苹果品种，也能大幅减少果实生锈的情况。
2、选择合适的地方建园
为了减少苹果膨果期幼果因污染、摩擦损伤等情况所诱发的果锈，建议在选择新果园建立地时，应当尽量选择向阳、避风、大风大雨少且远离废气排放较重工厂、空气漂浮灰尘杂质比较少的地方进行建园，以防幼果因为大风暴雨侵袭造成枝叶摩擦幼果和幼苗表面落尘蒙土污染等所造成的果锈。
3、果实套袋前打药要正确
一方面，在苹果套袋前选药时，应当选择药物毒性低、残留时间短、对幼果刺激性较小的药物，建议选择不容易导致幼果发生药害的悬浮剂、水分散粒剂、可溶性粉剂等安全性较高的药物，一定不可使用乳油类、硫制剂、铜制剂、砷硫制剂、药物增效剂或渗透剂以及部分有机磷类、三唑类等容易诱发药物中毒或刺激性较强的药物；同时，在配制药液时，一定要严格按照药物规定的用量与浓度使用，一定不可私自盲目的扩大用药量和药物使用浓度。
再一方面，如果对杀虫剂、杀菌剂、叶面肥等进行复配使用时，一定要按照肥药复配的先后顺序依次进行二次稀释配制，建议每次复配药物的种类数量控制在3种以内，配制药液时应当尽量选择清澈的河水、溪水等，不可直接使用井水（含钙镁离子较多容易发生药害）或浑浊水（容易堵塞塞头导致打药不均）进行稀释配制药液。
另一方面，打药时应当选择晴天无风的上午9-11点或下午4-6点左右时进行（花期不可打药），避免在中午高温或大风、低温天气时打药，同时应当选择雾化程度比较好的喷头，且打药时要均匀全面，既不能重喷，也不能漏喷，在打药时应当使喷头与幼果保持适当的距离（建议50公分左右），否则容易导致幼果的皮孔因药液压力过大而长果锈。
4、科学合理的进行套袋
一方面，在打完套袋前最后一遍药物后，应当等幼果表面的药液完全干燥后再进行套袋，如果果面药液未干则不可套袋，如果当天打完药液未干建议在第二天进行套袋。
另一方面，在为苹果选择果袋时，不可贪便宜购买质量比较差的果袋（比如说报纸果袋、透气排水性差的果袋、抗老化性差的果袋等），更不可使用早先使用过的旧果袋，建议大家到正规农资店购买大厂生产且质量稳定可靠的果袋，并且果袋的颜色与层数要根据所种苹果的品种灵活选择。
再一方面，大家应当提高自己的果实套袋水平，套袋时一定要先把果袋完全撑开、透气排水口孔完全打开，然后在把幼果小心套入袋内正中央，最后再用细铁丝完全把果袋口扎紧掺牢。
除此之外，如果遇到持续阴雨、连续大雾凝水的天气或者果园空气湿度过大、果园刚浇果大水的情况，咱们果农不可在此时套袋，应当等到天气变好且稳定后再进行套袋。
5、加强水肥与果树修剪管理，培育健壮树势
一方面，在果园中既要注意增施腐熟有机肥和磷钾肥，又要避免使用未经腐熟的农家粪肥，膨果期不可过量使用氮肥（如尿素、碳酸氢铵等分解后容易产生对幼果具有刺激性作用的氨气，同时过量使用氮肥会影响幼果膨大发育），此外，在花膨果期时应当注意补充钙肥、硼肥等中微量元素，如果有需要可以用0.3％的磷酸二氢钾+0.2％的硼砂溶液、1000倍新高脂膜等连续喷施2-3次，每隔7-10天喷施1次。
一方面，要注意保持好膨果期果园土壤的稳定湿度，建议把果园土壤的持续量保持在70-80％左右，当土壤持水量低于50％时应当及时浇水，当集中降雨后或浇灌大水后应当及时进行挖沟清渠、加强中耕进行排水撒施，以防果园空气湿度过大而使幼果长时间受潮。
再一方面，在苹果花果期时，要根据土壤肥力高低、树势强弱等进行合理疏花疏果，在保持树体合理负载的情况下维持健壮树势。
除此之外，要注意加强果树的修剪，可以结合冬剪、春剪、夏剪通过综合运用疏枝、截枝、甩放、拿枝、拉枝、摘心、扭稍、等方法，来调控好果树上枝稍的长势与数量，保持果园果树有一个良好的通风透光环境。除此之外，对于树势较弱的果树不可进行过重的环剥或环割。
6、做好不良天气的防御保护管理
一方面，在苹果花果期遇到低温冻害天气时，应当在恶劣天气到来前提前采取果园灌水、行间熏烟、树体喷水或者喷施防冻剂、磷酸二氢钾等方法，以此来保护幼花幼果、减少不良天气造成对花果造成的危害。
另一方面，如果苹果花期遇到持续阴雨或光照不足的天气，应当通过人工授粉、果园放蜂等方法来进行辅助授粉，以此确保苹果花期授粉受精充分、花果正常发育
