目前由于无视饮水机的日常消毒工作，很多公共场所饮水机流出的水可能已被“二次污染”。 因而，普通家庭饮水机运用3—6个月左右就应该停止一次消毒，而公共场所的饮水机运用频率高，消毒周期还应该更短些。另外，长期不消毒的饮水机， 即便换上的是新水，水质当天也会被污染，微生物数量更会急剧增加。饮水机超过3个月不清洗，所产生的大量细菌和有害物质进入人体后会引起消化、神经、泌尿和造血系统病变!
1、去电源插头，取下水桶，打开饮水机后面的排污管口（一般为白色塑料材质的旋钮），排净余水。然后，再打开冷热水开关放水。
2、取下“聪明座”（就是饮水机内接触泉水桶的部分），用酒精棉仔细擦洗饮水机内胆和盖子的内外侧，为下一步消毒做准备。
3、按照去污泡腾片或消毒剂的说明书配置消毒水（去污泡腾片和专用消毒剂超市都有卖，价格也不贵），导入饮水机，使消毒水充盈整个腔体，留置10~15分钟。
4、打开饮水机的所有开关，包括排污管和饮水开关，排净消毒液。
5、用清水连续冲洗饮水机整个腔体（这个过程建议把饮水机搬到卫生间里，保证水量充沛），打开所有开关排净冲洗液体。
目前主要的饮水机清洗设备有清洗机和消毒机两种清洗设备。
清洗机：饮水机清洗设备是应用加压水循环的物理原理，可有有效的对饮水机管道内壁一个持续不连续冲洗，保证冲洗的力度强度，彻底清洗水垢、杂质等；节约用水量，清洗设备固定的储水箱，储水量在1500毫升；有效保证清洗场地的洁净，整洁。
消毒机：采用国际先进技术，消毒机不用添加任何消毒药剂，应用臭氧强力杀菌，彻底处理了用传统办法清洗饮水机不彻底有残留等不安康要素。对饮水机内部任何角落停止消毒，能把饮水机内的细菌和澡类快速杀掉，设备可自动控制消毒时间，操作简单。同时还能够对厨房除腥、异味、冰箱除臭、食物保鲜、衣柜除臭、防霉、防蛀、鞋柜除臭等家居生活起到很大的功用。
