危害之一水垢
水垢的产生会降低制冷效果、增加电能的消耗、严重时造成主机高压故障停机，由于水中溶有大量碱土金属离子和碳酸氢根等。这些离子遇热后结合将生成不溶解的盐类即水垢。水垢的导热系数小于0.8.而冷凝器和蒸发器的铜管的导热系数为320，而两者相差悬虚。水垢将影响热的传递，这会带来两方面的问题：首先降低制冷效果，1毫米水垢将使制冷量降低20-40%；其次将使冷凝器压力升高，增大压缩机正背面压力差，导致电机负荷增加，多消电能。1毫米水垢将多消耗电能20-30%，水垢严重时将造成空调主机高压事故停机。
危害之二微生物藻类
微生物藻类的产生堵塞管道，阻碍水流动降低交效率。冷却塔的水温在32-37℃之间，比较适合微生物繁殖。藻类、细菌和真菌快速繁衍，这些微生物分泌出大量粘液，将水中不溶解性杂质粘合一起，附着于设备和管道的内表，阻碍水的流动和热的交换，多耗电能，造成高压运行。
危害之三水中的酸性物质
空调系统的冷却、冷冻水未经处理有极强的腐蚀性，腐蚀的存在使设备的使用寿命大为缩短。一旦腐蚀穿孔，水进入氟利昂（溴化锂）系统，使设备造成巨大的损失。因此决不能使设备有泄漏的现象。据统计未用水处理药剂做水处理预防的机组使用寿命缩短30-50%。这些危害决定了中央空调必需采用先进的清洗和水处理预防的维护，以确保其正常运行和使用。
