农产品加工需要办理卫生许可证的，注册公司流程如下：
一、公司名称核准 注册公司的第一步是向工商局申请公司名称查名，需要股东的身份证明并签署《企业名称预先核准申请书》，公司查名通过后，工商局颁发《企业名称预先核准通知书》，其有效期为半年。
二、签署工商登记材料 公司股东、法定代表人、监事等需签署《公司注册登记申请表》、《公司章程》、《企业告知承诺书》、《股东会决议》等工商注册登记材料。
三、开设公司临时帐户并验资 开设公司临时帐户，股东将注册资本打入帐户，聘请会计师事务所验资并出具验资报告。外资公司可以省略这项，要待外资公司注册完成后才开外汇帐户并进行验资。
四、办理公司营业执照 提交书面工商注册材料，办理营业执照。
五、刻章 公司营业执照审批下来后，刻公司公章、法人章、财务章。
六、办理组织机构代码证 提交组织机构代码登记书面材料，办理组织机构代码证及IC卡。
七、办理税务登记证 办理税务登记时，需提交财务人员身份信息。 上述事项办理完毕，公司注册基本完成，若开展实际业务，还需办理以下事宜：
八、开设公司基本帐户与纳税帐户 公司银行基本帐户是公司业务往来转帐及支付现金的帐户，纳税帐户是纳税申报后缴纳税收的专用帐户。
九、办理税种核定 需财务人员前往税务局办理票管员资格，同时办理税种核定。
十、购买发票 根据公司经营范围中所列业务范围，办理发票购买。
十一、特殊行业审批 若公司经营范围中有特殊行业或产品信息，需办理许可证。例如，经营食品要办理卫生许可证，经营危险产品要办理危险品经营许可证，注册农产品加工公司，需要办理卫生许可证。办理行业许可证的时间一般在公司名称核准之后，办理营业执照之前。 希望能帮助到你
