矿物都是有一定化学组成的单质或化合物，具有一定的结构。矿物内部的结构有的是规则的，有的是不规则的。决定这些结构的是离子、原子、分子等质点以及这些质点在矿物内部的排列。通常将质点呈有规则排列的矿物称为晶体矿物，质点呈不规则排列的矿物称为非晶体矿物。晶格中的质点都以一定的作用力互相联系着，这些作用力又称为键（化学键）。由于组成矿物的质点不同，键就不同， 因而矿物具有不同的结构。矿物晶格中存在着离子晶体、原子晶体、分子晶体和金属晶体。
离子晶体：是由阳离子和阴离子组成。阴阳离子之间通过静电引力相结合，这种键合方式称为离子键。离子键无方向性和饱和性，键合力强。阴、阳离子交替排列在晶格的节点上，离子堆积紧密。具有典型离子键的晶体的矿物有：岩盐、萤石、闪锌矿、白铅矿、铅矾、白钨矿、孔雀石、方解石等。
原子晶体：是由原子组成的，原子间通过共用电子对所产生的力相结合，这种化学键称为共价键。共价键具有方向性和饱和性，在原子晶体的晶格节点上排列的是中性原子，晶体中不存在自由电子，因此晶体是不良导体，且晶体结构的紧密程度远比离子晶体低。单纯以共价键联结的晶体在矿物中很少见。金刚石是典型的共价晶体。但有共价键成分的晶体却很多，如石英、金红石、锡石等。
分子晶体：分子晶体中分子是结构的基本单元。由极性分子和非极性分子之间通过范德华力（即分子间力）结合形成的化学键称为分子键。分子键键合力弱，无饱和性，无方向性。在分子晶体的晶格结点上排列的是分子，晶体中无自由运动的电子，是不良导体。又因为是弱键，对水的亲和力小。具有典型分子晶体的矿物有石墨、浑钼矿、菱形硫等，这些矿物多数呈层状结构，层与层之间是分子键。
金属晶体：金属晶体中自由电子运动于金属阳离子之间，金属阳离子与自由电子相互作用所形成的化学键，称为金属键。金属键无方向性和饱和性，堆积紧密。由金属键结合所形成的晶体成为金属晶体。金属晶体的晶格结点上分布的是金属阳离子。自然金属如自然金、自然铜属于此类晶体。
自然界中矿物晶体结构中仅有典型的单一键的情况是少数，有的晶体结构中存在过渡性质；例如金属氧化物（石英等）具有离子键、共价键的过渡性质；硫化矿物和氧化矿物大多数为离子键—共价键或离子键－共价键－金属键；氢氧化物和含氧盐类矿物则多数为离子键－分子键或离子键－共价键。多种元素所构成的晶体，常常同时存在几种不同的键；同一元素组成的晶体，有时也有不同的键。矿物结构不同，性质具有差异，金刚石和石墨就是典型例子
