2003 年 1 月 2 日，邓子德接到通知马上去执行一个紧急任务。原来河源市也出事了，广东省卫生厅派遣一个包括邓子德在内的 6 名专家组成的小组前往调查，这也是 SARS 疫情中，第一支由医疗专家与疾控中心研究人员共同组成的专家小组。河源的冬天比广州要冷，那天还下着小雨，会诊到深夜十一点的邓子德等三人睡不着，干脆跑到街上光顾快要打烊的大排档，坐着小板凳边吃粥边继续讨论。经过多次发言后才形成一致临床诊断意见，首次以“非典型肺炎”命名这种原因未明的疾病。他也直接否认了外界盛传他是“第一命名者”的说法。“简称为‘非典’那是北京的发明。”紧接着，专家组形成 SARS 病症被定义的第一份重要报告——广东省卫生厅赴河源会诊调查专家组工作报告，简称“河源报告”，首次出现“非典型肺炎爆发”等字眼。其间，邓子德还用自己才买的奥林巴斯相机拍摄下了黄杏初，叶钧强等人的片子，“他们本人都不知道，纯粹是自己学习研究之用。”
