一、所属纲属不同
两栖动物属于两栖纲，爬行动物属于爬行纲。
二、构造不同
爬行类( Reptilia)心脏有两心房两心室，心室有不完全隔膜，体温不恒定，是真正适应陆栖生活的变温脊椎动物，并由此产生出恒温的鸟类和哺乳类。两栖动物拥有四肢的脊椎动物。两栖动物的皮肤裸露，表面没有鳞片。
三、生活环境不同
爬行动物的生活环境：成体大多数生活在陆地上，少数种类生活在水中。
两栖动物的生活环境：幼体在水中，成体陆地和水。
四、特征不同
两栖动物的特征：幼体生活在水中，用鳃呼吸；成体大多生活在陆地上，也可在水中游泳，用肺呼吸，皮肤可辅助呼吸。
爬行动物的特征：体表覆盖角质的鳞片或甲；用肺呼吸；在陆地上产卵，卵表面有坚韧的卵壳。
