总署的称谓主要是沿袭了传统习惯,有的署是国务院组成部门(如审计总署),有的则不是(如海关总署)。
局有三种情况,第一种是具有部级职权,却不具部委地位的,称为总局,序列上属于国务院直属机构,如国税总局、体育总局等(局长也是正部级)。