全自动孵化机的使用步骤通常包括以下几个环节：
1. 准备鸡蛋：选择无瑕疵、无裂纹的鸡蛋，并保证鸡蛋在入机前已经恢复到室温，需要进行预热。
2. 填充水箱：打开下部机箱并将水箱中的清水加满。一般来说，孵化期间水的保持非常重要，需每天检查并进行补充。
3. 调整孵化机的温度和湿度：根据所要孵化的动物品种和孵化期需要的温度和湿度，进行相应的调整。孵化机露台内层的水容量会影响机器内湿度。龙猫、大鼠等小动物的孵化一般保持在26-28℃，家禽孵化温度则一般在37-39℃。湿度在0-100%之间，因品种而异，例如鹅类一般要求湿度要高于鸡、鸭等家禽。
4. 安放鸡蛋：在安放鸡蛋前，先将孵化机的架子取出，将鸡蛋放入孵化机，再将架子慢慢放回去。
5. 监测孵化进程：开启孵化机，保持孵化机环境的卫生和稳定，同时每天测量温度和湿度以及鸡蛋的状态，保持充足的水源。
6. 孵化完成：等待鸟类或动物出生。
需要注意的是，全自动孵化机由于其共振噪音系统较大，其扰动会对其它电子设备造成干扰影响。同时它也需要安放在内嵌减震海绵的桌子或地面上，以保持稳正静止状态。
全自动孵化机使用步骤：
1、 全自动孵化机采用C3 C5 两个加热管加热，采用水加湿和电加湿两种加湿方法。
2、 开机时全部打开C3 C5 水加湿（加湿C3） 电加湿（加湿C5） 减少预热时间，试机快。
3、当温度达到设定温度37.5度，湿度60%时，可以关掉加热C3也可以关掉加湿C3 ,如果湿度效果达不到，可以水加湿共同运行。
4、后期湿度要求大，可共同打开水加湿和电加湿。
5、如果夏天C5可以正常供热，能达到孵化温度，关掉C3就可以，如果冬天，C5到不到孵化温度，可以倒开C3 C5 共同加热，达到孵化所需温度。正常运转中有水电两种加湿方法（加湿C3 加湿C5），如果水加湿（加湿C3）达不到所需湿度，可以打开电加湿（加湿C5）共同加湿。
6、其中一个加热管不能正常工作，可打开另一个开关，不影响正常孵化。
7、在所有家禽珍禽出雏的高峰期（例19-21天时），关掉加热C3 C5能达到孵化温度。只需要打开，电加湿（加湿C5） 水加湿（加湿C3）。（因为后期幼雏会释放大量的热量，以免温度太高影响出雏）
8、全自动孵化箱后壁的通风口，在孵化期（例如鸡蛋）如果温度达到正常孵化所需温度，通风口不需要关闭，如果达不到正常孵化所需温度，可以关闭1-2个通风口。到出雏期时所有的皮盖通风口，全部打开。使用炉火加温时，水盘上应该一层塑料薄膜，根据所需湿度大小，开一条缝或挖一个孔即可自动供湿。
