T1和T2航站楼均有国内和国际航班,由于3号线南机场站和北机场站分别对应白云国际机场1号航站楼和2号航站楼,乘坐地铁前往机场的乘客在购票时一定要关注航空公司发送的短信或电子机票旅行行程,选择不同的地铁站下车,前往相应的航站楼办理登机手续。
T1至T2航站楼之间有地铁和班车,免费班车位于1号航站楼3楼出发,大厅10号门和2号航站楼3楼出发大厅42号门。两层之间的班车时间为5-15分钟,广州地铁3号线北线“机场南”站(T1)和“机场北”站(T2)之间也可实现24小时运营免费乘车。
T1航站楼分为主楼和东西两翼,各有三个手指走廊。东翼叫A区,西翼叫B区,东西翼的禁区,即A区和B区,除了国内电瓶车的国际中转外,不能直接相连。