高速服务区过夜是否收超时费要看有无相关证据证明在服务区休息,如果是因为正当理由超时并能提供证明的可以免收超时费。超时费仅仅针对的是超出规定时间没有驶离高速公路的车辆,目的是为了打击驾驶员逃费所制定的惩罚性措施。