微囊藻是蓝藻的代表植物之一,它属于色球藻目,植物体是球形,不规则或者具有很多穿孔的浮游性群体。群体细胞很多,均匀地分布于无结构的基质中。
细胞球体多数具有气泡,微囊藻分泌一种能抑制其他藻类生长的物质有些种类还可以产生一种叫做致使因子的毒素,能毒害摄食藻类动物。