1.定期清洗，根据自吸泵负压值超过0.08和和出水量来判定膜清洗时间（一般为2-3月）
2.清洗方式，MBR膜清洗一般分为2种，在线清洗和离线清洗，根据进水水质，清洗时所加药剂也不一样，（一般性用次氯酸钠溶液和柠檬酸片剂）
3.在线清洗操作，在负压不高出水量一般时，（3个月左右）需要进行MBR膜在线清洗，步骤为先把膜池内污水抽走，用清水冲洗膜丝上污泥，反复冲洗后把水抽走，再加入清水再以膜池m³/2L次氯酸钠溶液的配比浸泡30分钟后（先注满清水再加药剂）开启爆气装置（风机）24小时。爆气结束后抽空膜池再用清水冲洗即可。
4.离线清洗操作，当次在线清洗结束后，（一般为3个月左右）需离线清洗，需抽空膜池内污水，人工拆卸模架上的膜片，（注意活接和膜丝不要损坏），拆卸下的默片需用清水反复冲洗（正反面），然后用次氯酸钠溶液浸泡30分钟后爆气24小时，抽空后再用柠檬酸片剂浸泡后30分钟再用爆气24小时，药洗结束后，方可再安装回模架（如有膜丝断开可打结处理）。
5.一般性的生活污水，使用MBR膜清洗一般为3个月在线清洗半年离线清洗一次。
