第一，由于病毒的彻底寄生性，所有病毒毫无例外。
因此，病毒决不可能起源于细胞之前，只能先有细胞后有病毒。
第二，已经证明，有些病毒的核酸与哺乳动物细胞DNA某些片段的碱基序列十分相似。
因为细胞癌基因与反转录病毒的病毒癌基因具有同源序列，从而普遍认为病毒癌基因起源于细胞癌基因。
第三，病毒可以看作DNA或RNA与蛋白质的复合大分子，与细胞内核蛋白有相似之处。
第四，真核生物中，尤其是脊椎动物中普遍存在的第二类反转录转座子的两端含有长末端重复序列，结构与整合于基因组上的反转录病毒十分相似。
普遍认为，两者有相同的起源。
